Bioinformatics-2017 DeepLoc:prediction of protein subcellular localization using deep learning

论文地址:https://academic.oup.com/bioinformatics/article/33/21/3387/3931857

论文网站:http://www.cbs.dtu.dk/services/DeepLoc

DeepLoc:预测亚细胞定位

Abstract

真核蛋白亚细胞定位的预测由于其在蛋白质组学研究中的相关性,是生物信息学中一个研究广泛的课题。但大多数预测依赖于从知识数据库中对同源物的注释。对于没有注释同源物存在的新蛋白质,以及为了预测序列变异的影响,希望有仅从序列信息中预测蛋白质特性的方法

提出了一个预测模型和DeepLoc数据集

Introduction

蛋白质在真核细胞的不同隔间中具有广泛多样的功能。蛋白质的功能取决于它所在的隔室或细胞器,因为它为其功能提供了一个生理背景。然而,异常的蛋白质亚细胞定位可以影响蛋白质所表现出的功能,并有助于许多人类疾病的发病机制;如代谢、心血管和神经退行性疾病,以及癌症

之前的工作依赖于注释蛋白活具有注释相近同源物的序列

Materials and methods

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Results

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