平台 · arXiv 2026

VenusFactory2

面向蛋白质发现与定向进化的自进化 AI 智能体——免费 Web 平台，在浏览器中编排数据、工具与 Venus / Prot* 模型。

Yang Tan, Lingrong Zhang, Mingchen Li, Yuanxi Yu, Bozitao Zhong, Bingxin Zhou, Nanqing Dong, Liang Hong

演示 论文 代码

方法

原版 VenusFactory （ACL Demo 2025）将数据检索与 PLM 微调打包为开源工具链。 VenusFactory2 将其升级为免费 Web 产品，提供 playground、API 与面向智能体的接口——湿实验与计算用户无需搭建本地环境即可评分突变、跑基准并调用模型。

  • 浏览器访问 venusfactory.bio
  • 适应度 / 工程任务的交互 playground
  • 集成 VenusX、VenusREM、ProSST、ProtSSN 及相关检查点
  • 技术报告：arXiv:2603.27303

集成方法

平台接入的模型与基准包括：

  • VenusX——细粒度功能基准
  • VenusREM——检索增强突变评分
  • ProSST / ProtSSN——序列–结构 PLM
  • VenusRAR——智能体 Rank-and-Reason 筛选（同线工作）

引用

若使用 VenusFactory2，请引用技术报告：

@misc{tan2026venusfactory2,
  title={Self-evolving AI agents for protein discovery and directed evolution},
  author={Tan, Yang and Zhang, Lingrong and Li, Mingchen and Yu, Yuanxi and Zhong, Bozitao and Zhou, Bingxin and Dong, Nanqing and Hong, Liang},
  year={2026},
  eprint={2603.27303},
  archivePrefix={arXiv},
  primaryClass={q-bio.QM},
  url={https://arxiv.org/abs/2603.27303}
}

ACL Demo 工具链论文见 VenusFactory。